MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR02

Total Repeats: 7281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013745	GCCG	2	8	576	583	0 %	0 %	50 %	50 %	284172525
2	NC_013745	CCG	2	6	690	695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172525
3	NC_013745	GCGT	2	8	773	780	0 %	25 %	50 %	25 %	284172525
4	NC_013745	AGA	2	6	802	807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284172525
5	NC_013745	ACG	2	6	906	911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172525
6	NC_013745	TCG	2	6	949	954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172525
7	NC_013745	CGG	2	6	1001	1006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172525
8	NC_013745	CGA	2	6	1024	1029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172525
9	NC_013745	TACG	2	8	1070	1077	25 %	25 %	25 %	25 %	284172525
10	NC_013745	TC	3	6	1368	1373	0 %	50 %	0 %	50 %	284172526
11	NC_013745	GAGC	2	8	1394	1401	25 %	0 %	50 %	25 %	284172526
12	NC_013745	ACG	2	6	1456	1461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172526
13	NC_013745	GGAG	2	8	1463	1470	25 %	0 %	75 %	0 %	284172526
14	NC_013745	TCG	2	6	1471	1476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172526
15	NC_013745	CG	3	6	1491	1496	0 %	0 %	50 %	50 %	284172526
16	NC_013745	CGGG	2	8	1525	1532	0 %	0 %	75 %	25 %	284172526
17	NC_013745	CCG	2	6	1546	1551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172526
18	NC_013745	GGGC	2	8	1566	1573	0 %	0 %	75 %	25 %	284172526
19	NC_013745	CGAC	2	8	1607	1614	25 %	0 %	25 %	50 %	284172526
20	NC_013745	GGAC	2	8	1732	1739	25 %	0 %	50 %	25 %	284172526
21	NC_013745	GAC	3	9	1770	1778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172526
22	NC_013745	GGA	2	6	1787	1792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172526
23	NC_013745	TCG	2	6	1816	1821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172526
24	NC_013745	CGA	2	6	2063	2068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172526
25	NC_013745	ACG	2	6	2074	2079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172526
26	NC_013745	GTC	2	6	2081	2086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172526
27	NC_013745	CCG	2	6	2089	2094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172526
28	NC_013745	GAG	2	6	2130	2135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172526
29	NC_013745	TCC	2	6	2155	2160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172526
30	NC_013745	GAC	2	6	2172	2177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172526
31	NC_013745	CGACG	2	10	2180	2189	20 %	0 %	40 %	40 %	284172526
32	NC_013745	CAC	2	6	2220	2225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284172526
33	NC_013745	TCG	2	6	2245	2250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172526
34	NC_013745	CCG	2	6	2308	2313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172526
35	NC_013745	TCA	2	6	2460	2465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172527
36	NC_013745	GCA	2	6	2466	2471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172527
37	NC_013745	TCG	2	6	2488	2493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172527
38	NC_013745	GAC	2	6	2521	2526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172527
39	NC_013745	GGCG	2	8	2594	2601	0 %	0 %	75 %	25 %	284172527
40	NC_013745	CGA	2	6	2654	2659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172527
41	NC_013745	CGG	2	6	2674	2679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172527
42	NC_013745	CGC	2	6	2720	2725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172527
43	NC_013745	CGA	2	6	2767	2772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172527
44	NC_013745	TGA	2	6	2824	2829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172527
45	NC_013745	TCA	2	6	2863	2868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172527
46	NC_013745	CGCC	2	8	2870	2877	0 %	0 %	25 %	75 %	284172527
47	NC_013745	GCCGA	2	10	2898	2907	20 %	0 %	40 %	40 %	284172527
48	NC_013745	TCA	2	6	2911	2916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172527
49	NC_013745	TAC	2	6	2946	2951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172527
50	NC_013745	GAC	2	6	2961	2966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172527
51	NC_013745	GGAT	2	8	2971	2978	25 %	25 %	50 %	0 %	284172527
52	NC_013745	GCG	3	9	2989	2997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172527
53	NC_013745	ACG	3	9	3091	3099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172527
54	NC_013745	AGC	2	6	3100	3105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172527
55	NC_013745	TCG	2	6	3178	3183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172527
56	NC_013745	CACATC	2	12	3198	3209	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	284172527
57	NC_013745	GAC	3	9	3213	3221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172527
58	NC_013745	GTCC	2	8	3350	3357	0 %	25 %	25 %	50 %	284172527
59	NC_013745	GCC	2	6	3371	3376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172527
60	NC_013745	GCC	2	6	3420	3425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172527
61	NC_013745	CGA	2	6	3443	3448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172527
62	NC_013745	TCGT	2	8	3474	3481	0 %	50 %	25 %	25 %	284172527
63	NC_013745	CGG	2	6	3787	3792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172528
64	NC_013745	TGC	2	6	3815	3820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
65	NC_013745	TCG	4	12	3824	3835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
66	NC_013745	TCG	2	6	3845	3850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
67	NC_013745	AAC	2	6	3874	3879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284172528
68	NC_013745	CGA	2	6	3933	3938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
69	NC_013745	CGA	3	9	3990	3998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
70	NC_013745	TCG	2	6	4022	4027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
71	NC_013745	TCG	2	6	4109	4114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
72	NC_013745	CGA	2	6	4158	4163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
73	NC_013745	GCC	2	6	4243	4248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172528
74	NC_013745	CGA	2	6	4287	4292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
75	NC_013745	GTC	3	9	4300	4308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
76	NC_013745	CCA	2	6	4344	4349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284172528
77	NC_013745	GAG	2	6	4357	4362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172528
78	NC_013745	GAC	2	6	4368	4373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
79	NC_013745	CGA	2	6	4386	4391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
80	NC_013745	GGT	2	6	4398	4403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284172528
81	NC_013745	CGC	2	6	4421	4426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172528
82	NC_013745	TCGA	2	8	4471	4478	25 %	25 %	25 %	25 %	284172528
83	NC_013745	TCG	2	6	4520	4525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
84	NC_013745	GCT	2	6	4536	4541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
85	NC_013745	TCG	2	6	4586	4591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
86	NC_013745	CGT	2	6	4608	4613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
87	NC_013745	CGT	2	6	4647	4652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
88	NC_013745	GCC	2	6	4658	4663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172528
89	NC_013745	CGA	2	6	4752	4757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
90	NC_013745	GGC	2	6	4839	4844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172528
91	NC_013745	CGA	2	6	4899	4904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
92	NC_013745	CA	3	6	4944	4949	50 %	0 %	0 %	50 %	284172528
93	NC_013745	GGAT	2	8	4952	4959	25 %	25 %	50 %	0 %	284172528
94	NC_013745	ACG	2	6	4973	4978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
95	NC_013745	GAT	2	6	5010	5015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172528
96	NC_013745	GAG	2	6	5026	5031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172528
97	NC_013745	CGC	2	6	5055	5060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172528
98	NC_013745	CGAG	2	8	5075	5082	25 %	0 %	50 %	25 %	284172528
99	NC_013745	GAG	2	6	5101	5106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172528
100	NC_013745	TCG	2	6	5215	5220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
101	NC_013745	ACG	2	6	5221	5226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
102	NC_013745	GAG	2	6	5227	5232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172528
103	NC_013745	CGT	2	6	5237	5242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
104	NC_013745	CGA	2	6	5247	5252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
105	NC_013745	CGGC	2	8	5282	5289	0 %	0 %	50 %	50 %	284172528
106	NC_013745	GGC	2	6	5304	5309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172528
107	NC_013745	GCC	2	6	5317	5322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172528
108	NC_013745	GAG	2	6	5323	5328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172528
109	NC_013745	CGT	2	6	5334	5339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
110	NC_013745	CGA	2	6	5343	5348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
111	NC_013745	CGA	2	6	5352	5357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
112	NC_013745	CGT	2	6	5358	5363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
113	NC_013745	CGA	2	6	5403	5408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
114	NC_013745	CGA	2	6	5424	5429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
115	NC_013745	GAAC	2	8	5483	5490	50 %	0 %	25 %	25 %	284172528
116	NC_013745	CGG	2	6	5496	5501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172528
117	NC_013745	AGG	2	6	5525	5530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172528
118	NC_013745	AGC	2	6	5534	5539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
119	NC_013745	CGAC	2	8	5561	5568	25 %	0 %	25 %	50 %	284172528
120	NC_013745	CAG	2	6	5578	5583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
121	NC_013745	CGG	2	6	5600	5605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172528
122	NC_013745	CGA	2	6	5607	5612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
123	NC_013745	CGC	2	6	5613	5618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172528
124	NC_013745	GTC	2	6	5623	5628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
125	NC_013745	CGAG	2	8	5636	5643	25 %	0 %	50 %	25 %	284172528
126	NC_013745	GAG	2	6	5652	5657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172528
127	NC_013745	GAG	2	6	5671	5676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172528
128	NC_013745	CGA	2	6	5754	5759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
129	NC_013745	CGA	2	6	5796	5801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
130	NC_013745	GAT	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172528
131	NC_013745	CGC	2	6	5847	5852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172528
132	NC_013745	CCG	2	6	5855	5860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172528
133	NC_013745	CA	3	6	5891	5896	50 %	0 %	0 %	50 %	284172528
134	NC_013745	CGG	2	6	5957	5962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172528
135	NC_013745	GTC	2	6	5983	5988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
136	NC_013745	CGA	2	6	5991	5996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
137	NC_013745	CGACAC	2	12	6009	6020	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	284172528
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139	NC_013745	CGAC	2	8	6068	6075	25 %	0 %	25 %	50 %	284172528
140	NC_013745	CGA	3	9	6117	6125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
141	NC_013745	CGA	2	6	6129	6134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
142	NC_013745	CGA	2	6	6186	6191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
143	NC_013745	CGTT	2	8	6282	6289	0 %	50 %	25 %	25 %	284172529
144	NC_013745	GCGACG	2	12	6303	6314	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	284172529
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146	NC_013745	CGC	2	6	6375	6380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172529
147	NC_013745	GGCG	2	8	6443	6450	0 %	0 %	75 %	25 %	284172529
148	NC_013745	ATCGA	2	10	6462	6471	40 %	20 %	20 %	20 %	284172529
149	NC_013745	GCG	2	6	6480	6485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172529
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152	NC_013745	GAC	2	6	6614	6619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172529
153	NC_013745	CGT	2	6	6643	6648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172529
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155	NC_013745	CCGCAC	2	12	6692	6703	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	284172529
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157	NC_013745	CGA	2	6	6781	6786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172529
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159	NC_013745	CGA	2	6	6819	6824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172529
160	NC_013745	CCGT	2	8	6825	6832	0 %	25 %	25 %	50 %	284172529
161	NC_013745	CCGA	2	8	6866	6873	25 %	0 %	25 %	50 %	284172529
162	NC_013745	CGT	2	6	6886	6891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172529
163	NC_013745	CGA	2	6	6892	6897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172529
164	NC_013745	GCG	2	6	6939	6944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172529
165	NC_013745	CGAT	2	8	6954	6961	25 %	25 %	25 %	25 %	284172529
166	NC_013745	GAC	2	6	6964	6969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172529
167	NC_013745	GCCG	2	8	6976	6983	0 %	0 %	50 %	50 %	284172529
168	NC_013745	ACGTCC	2	12	7011	7022	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	284172529
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172	NC_013745	CTC	2	6	7181	7186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172529
173	NC_013745	CGA	2	6	7228	7233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172529
174	NC_013745	TCG	2	6	7404	7409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172530
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184	NC_013745	GGAG	2	8	7717	7724	25 %	0 %	75 %	0 %	284172530
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234	NC_013745	ACT	2	6	9792	9797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172533
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239	NC_013745	CGA	2	6	10030	10035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172533
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241	NC_013745	GACC	2	8	10102	10109	25 %	0 %	25 %	50 %	284172533
242	NC_013745	CCG	2	6	10158	10163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172533
243	NC_013745	GCC	2	6	10172	10177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172533
244	NC_013745	GAA	2	6	10216	10221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284172533
245	NC_013745	CGA	2	6	10252	10257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172533
246	NC_013745	TCG	2	6	10269	10274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172533
247	NC_013745	GAC	2	6	10291	10296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172533
248	NC_013745	CG	3	6	10322	10327	0 %	0 %	50 %	50 %	284172533
249	NC_013745	ACG	2	6	10347	10352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172533
250	NC_013745	TCG	2	6	10356	10361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172533
251	NC_013745	CGGGC	2	10	10396	10405	0 %	0 %	60 %	40 %	284172533
252	NC_013745	CGG	2	6	10507	10512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172533
253	NC_013745	CTA	2	6	10546	10551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172533
254	NC_013745	AGG	3	9	10602	10610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172533
255	NC_013745	GAG	2	6	10652	10657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172533
256	NC_013745	ACG	2	6	10674	10679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172533
257	NC_013745	GGCG	2	8	10753	10760	0 %	0 %	75 %	25 %	284172533
258	NC_013745	GAC	2	6	10780	10785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172533
259	NC_013745	CGG	2	6	10810	10815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172533
260	NC_013745	CGA	2	6	10830	10835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172533
261	NC_013745	GGACT	2	10	10862	10871	20 %	20 %	40 %	20 %	284172533
262	NC_013745	CGA	2	6	10881	10886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172533
263	NC_013745	ACT	2	6	10902	10907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172533
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265	NC_013745	CGG	2	6	11276	11281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172534
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269	NC_013745	GCC	2	6	11407	11412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172534
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271	NC_013745	CGA	2	6	11458	11463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172534
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371	NC_013745	GCGAC	2	10	15972	15981	20 %	0 %	40 %	40 %	284172538
372	NC_013745	CGT	2	6	15991	15996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172538
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375	NC_013745	GAGC	2	8	16274	16281	25 %	0 %	50 %	25 %	284172538
376	NC_013745	GATC	2	8	16284	16291	25 %	25 %	25 %	25 %	284172538
377	NC_013745	TCCG	2	8	16302	16309	0 %	25 %	25 %	50 %	284172538
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381	NC_013745	TC	3	6	16438	16443	0 %	50 %	0 %	50 %	284172538
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383	NC_013745	GAG	2	6	16466	16471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172538
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